HuMAN-PaGe

L'applicazione della paleogenetica può fornire nuove conoscenze sulla storia evolutiva umana e microbica. Nel corso del mio progetto di dottorato, mi propongo di utilizzare il DNA antico per dedurre le strutture di parentela umana e la genetica delle popolazioni, estendendo l'analisi alla ricostruzione del microbioma e dei patogeni associati all'uomo. Utilizzando tecniche di sequenziamento di nuova generazione (next generation sequencing) e di arricchimento (target-enrichment) così come analisi bioinformatiche tramite l´utilizzo di pipeline specifiche per l´analisi dei dati genetici del DNA antico, analizzerò il DNA umano e microbico da diversi resti umani antichi.

Questo progetto si compone di tre parti. In primo luogo, circa 30 individui provenienti da una fossa comune di 7000 anni fa a Talheim, in Germania, saranno analizzati per ricostruire possibili relazioni di parentela, nonché le loro affinità genetiche e la genetica delle popolazioni. In secondo luogo, verranno effettuate analisi metagenomiche da antichi calcoli dentali di individui vissuti in Trentino-Alto Adige nel XVII secolo. Insieme ai nostri collaboratori di Trento, i dati microbici antichi saranno confrontati con quelli ottenuti da calcoli dentali di individui moderni provenienti dalla stessa area grografica. Questo permetterà di chiarire l'evoluzione dei microbiomi orali umani. Con i dati antropologici disponibili, sarà anche possibile confrontare la flora orale antica patogena e non patogena. In terzo luogo, saranno studiati agenti patogeni specifici, come il batterio Yersina pestis (l'agente che causa la peste) e il Mycobacterium tuberculosis, provenienti da antichi resti umani distribuiti in Italia settentrionale e in Europa, al fine di ricostruire la storia epidemiologica ed evolutiva di questi agenti.