The Institute for Alpine Environment cooperates with numerous national and international institutions, universities, public organizations and private service providers:
- AGL Arbeitsgruppe für Landnutzungsplanung
- Alpine Space Programme
- Amt der Kärntner Landesregierung
- Amt der Salzburger Landesregierung
- Austrian Academy of Science
- Autonomous Province of Bozen - South Tyrol
- Bayerische Akademie für Naturschutz und Landschaftspflege (ANL)
- BOKU: University of Natural Resources and Applied Life Sciences, Vienna
- Bosch & Partner GmbH
- Cemagref - Institut de recherche en sciences et technologies pour l'environnement
- Consorzio Parco Nazionale dello Stelvio - National Park Stilfserjoch
- Duke University
- ETH Zurich - Swiss Federal Institute of Technology Zurich
- Federal Research and Training Centrefor Forests, Natural Hazards and Landscape (BFW)
- Fondazione Edmund Mach
- Free University of Bozen - Bolzano
- Friedrich-Alexander University of Erlangen- Nuremberg
- Georg-August-Universität Göttingen
- Global Mountain Biodiversity Assessment (GMBA)
- HLFS Kematen für Land- und Ernährungswirtschaft
- IER - Institute for Economic Research, Chamber of Commerce Bolzano/Bozen
- Ifuplan
- Imperial College London
- Instituto Pirenaico de Ecologia
- Julius-Maximilians-Universität Würzburg
- Laboratoire d'Ecologie Alpine, CNRS, Université Joseph Fourier
- Land Tirol
- Ländliches Fortbildungsinstitut Tirol (LFI)
- LFZ Raumberg-Gumpenstein
- Long-term Biodiversity, Ecosystem and Awareness Research Network (ALTER-Net)
- Ludwig-Maximilians-Universität München
- Museum of Nature South Tyrol
- Österreichische Vereinigung für Agrarwissenschaftliche Forschung (ÖVAF)
- Paul Scherrer Institute (PSI)
- Pädagogisches Institut für die deutsche Sprachgruppe (PI)
- RaumUmwelt®Planungs-GmbH
- Scientific Research Centre of the Slovenian Academy of Sciences and Arts
- Società Italiana di Ecologia (S.It.E.)
- Südtiroler Bauernbund
- Tirolean State Museums Ltd.
- TUM Technische Universität München
- Umweltbüro Klagenfurt
- Unione Nazionale Comuni Comunità Enti Montani (UNCEM)
- Università Ca' Foscari Venezia
- Università degli Studi di Parma
- Università degli Studi di Trento
- Università degli Studi di Trieste
- Università di Ferrara
- Universität Augsburg
- Universität Basel
- Universität Bayreuth
- Université Grenoble Alpes
- Universität Innsbruck
- Versuchszentrum Laimburg
- WIFO - Österreichisches Institut für Wirtschaftsforschung
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